Lo mataron a ese doctor porque el actor se fue?

Básicamente (así pasa siempre igual, los cambian porque renuncian). Según él siempre fue el plan 2 temporadas, pero se habla de problemas de agenda porque se fue a Los Ángeles para expandir su carrera y la siguiente temporada no tiene fecha de estreno todavía porque no saben si Disney+ les va a renovar contrato (está confirmada con o sin ellos, pero no se sabe para cuando), así que imagínate si en el mientras tanto rechaza proyectos o está sin trabajar hasta que se se decidan. De nuevo, esto último es un rumor.

¿Pero como va aceptar ser el doctor que es el prota por solo 2 temporadas nomas?
Los doctores no duran un montón de temporadas en general?

Nah, la gran mayoría dura 3 temporadas (por desgracia). Lo máximo que ha durado un actor fueron 5 y 7 temporadas en los 70 en el caso de los doctores 3 y 4, pero después de eso han durado 3 temporadas la mayoría. Igual 3 temporadas =/= 3 años porque a veces hay años que no sale temporada nueva y solo sacan especiales, por ejemplo en caso de Ncuti se anunció su cast en 2022, debutó con 2 especiales en 2023 y tuvo 2 temporadas en 2024 y 2025. Si se siente como poco, realmente hubiéramos querido verlo más tiempo, pero respondiendo a tu duda tuvo más aventuras que los doctores 6 (también 2 temporadas), 8 (una única película y un corto de 10 minutos) y 9 (una única temporada). Aparte están los doctores War y Fugitive, dos Doctores oficiales pero que en la serie por cuestiones de la historia no tienen número y solo han protagonizado un capítulo y un par de cameos (en el caso de la Fugitive merece ser una Doctora por varias temporadas).

Luego de retirarse la mayoría sigue siendo el Doctor en capítulos grabados en audio que son semi canon.
Después tenés a las companion que son las co-protagonistas y algunas solo duran una temporada. Es un montón si llegan a durar 3.

Un quilombo es esa serie en producción parece si ni duran 3 temporadas.